W celu zapewnienia jak najdalej idącej automatyzacji oraz szybkości obsługi procesów zachodzących na uczelniach, koniecznym jest integracja z systemami bankowości elektronicznej pozwalające na import wpłat oraz obsługę płatności masowych.
Struktura systemu BAZUS daje możliwość dwukierunkowej integracji z systemami bankowości elektronicznej:
import przelewów z banku - automatyczne wyszukiwanie studentów na podstawie indywidualnych rachunków bankowych lub według wybranego parametru (np. PESEL, numer albumu, itp), rozróżnianie rodzajów wpłat (czesne, wpisowe, itp) i automatyczne przypisywanie wpłat do studentów w systemie BAZUS z możliwością ręcznego wyboru;
eksport poleceń zapłaty - gromadzenie informacji o rodzajach, wysokości i terminach wypłat stypendiów w systemie BAZUS, automatyczne generowanie plików wymiany z systemem bankowości elektronicznej.
Integracja systemu BAZUS z systemem bankowości elektronicznej zapewnia błyskawiczną i wiarygodną aktualizację informacji na temat rozliczeń studenta.